イタリアが舞台となった前シリーズの放送から2年ー ルパンとその仲間たちが帰ってきた!ルパン三世と次元大介はフランスにいた。ある田舎町のアパルトマンの一室からドラマが始まる。麻薬や銃など非合法な物まで何でも買える闇のサイト、`マルコポーロ’。デジタル通貨を盗み出すため、ルパン達は厳重に警備されている巨大サーバ施設へ侵入する。そこで出会ったのは謎の天才ハッカー少女、アミ。ルパンはアミと共に、マルコポーロの罠に立ち向かっていくが、敵が仕掛けた`ルパン・ゲーム’により、全世界から監視されるハメに。。。しだされるアミの謎、そしてルパン三世の過去を知る男の出現ーーールパンはいまだかつてないほどの窮地に立たされていく!